五缘湾水上保税仓库可存放以转口贸易方式进境的游艇、外商暂时存放的游艇、未办结海关手续的一般贸易进口游艇、已保税仓库货物方式进口的游艇及经海关批准的其他未办结海关手续的进口游艇。据路桥游艇公司透露，建设工作将于今年12月份启动，并预计于2013年上半年正式投入使用。
五缘湾水上保税仓库是厦门路桥游艇开发有限公司继2010年创立陆上游艇保税仓库之后的又一创举。这就意味着上百尺的进口游艇都可以通过保税的方式进入到厦门五缘湾。据悉，路桥游艇公司于2010年4月设立了五缘湾游艇帆船保税仓库（陆上），这是中国第一个专业游艇保税仓库，规模3000平方米，可用于停放65尺（20米）以下进口的各类中小型游艇及进口的游艇帆船零配件。保税仓自运营以来入驻船艇34艘，并成功售出24艘，效果显著，得到广大游艇代理商的青睐，长期出现饱和状态。但由于物流运输及场地限制，无法满足更多船商及更大船艇的入驻需求，且尺寸较大的游艇长期停放在陆地上容易变形。因此，水上保税仓库的设立，恰好弥补原有陆上保税仓库无法停放大型游艇的不足。
作为五缘湾游艇帆船港的运营商，厦门路桥游艇开发有限公司为完善各项配套服务，积极推进五缘湾水上保税仓库的设立，于2011年5月份正式跟厦门海关提出设立水上游艇保税仓申请，并经过多次的可行性研究，该项目也得到了海关总署的高度重视，多次派员前来五缘湾考察调研，经过一年多的努力，终于获得了批复。
众所周知，进口游艇近44%的关税压力对游艇代理商来说是一笔巨大的负担。陆上保税仓的设立有效降低了游艇代理商的采购成本，解决代理商以往只能靠产品图册卖艇的尴尬局面。有了实艇的展示，买家不用出国门就能挑选心仪的国际品牌游艇。水上游艇保税仓的设立，将吸引更多大型的进口游艇入驻厦门。这标志着厦门游艇产业国际化程度又迈上了一个新台阶，也标志着五缘湾游艇港在中国游艇业界又一次新的突破。