车贷第二天补扣可能会影响征信。车贷第二天补扣属于逾期行为，补扣成功会影响征信，逾期记录会自用户还款后保留五年。若是用户办理车贷的金融机构对于车贷还款有设置还款宽限期的，那么只要第二天补扣是在还款宽限期内，那么是不会对用户的征信造成不良影响的。但一般情况下在银行办理的车贷是没有还款宽限期的。
如果车贷没有还款宽限期，那么还款日当天未扣款成功，第二天还款就属于逾期还款。车贷在还款日扣款失败，会在第二天重新进行扣款。而第二天扣款失败，还会以此类推继续扣下去，直到扣满还款金额为止。
同时，若因个人原因造成的逾期，逾期记录会上征信；而因银行系统原因导致扣款失败，即使逾期记录上征信，用户可以提出异议。
总而言之，在还款日之前就将还款金额存入还款银行卡中，可以有效避免还款日当天扣款失败。