五代、宋、元时期
北宋宣和六年（公元1124年），伊州、蒲类归属西辽。
13世纪初，蒙古人崛起于漠北。宋嘉定二年（1206年），孛儿只铁木真（成吉思汗）为蒙古大汗。3年以后西州回鹘“亦都护”巴而术阿而忒的斤臣属蒙古。哈密归附蒙古后，也没有并入高昌成为高昌畏兀儿的一部分，而是和高昌并存的一个地方政权。
南宋淳祜十一年（1251），蒙宪宗在西州回鹘建别失八里行省州改称哈密力。
至元十六年（1279年），忽必烈灭南宋，建都大都（今北京），任命察合台曾孙阿只吉镇守别失八里，兼辖天山南路畏吾儿哈喇火者（即高昌）及哈密力等处屯戍军事。
至元十八年（1281年），设甘肃行省，哈密隶甘肃行省管辖。
延佐六年（1319年），皇帝敕命哈密力人和畏吾儿人（即高昌人）自相讼，可以由自己的头目处理，如果和其他百姓争论，则由自己的头目和地方官吏共同审讯。元末，察合台后裔兀纳失里据哈密，为威武王。元覆亡后，兀纳失里割据自立，称哈密国。
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