喀什是维吾尔语“喀什噶尔”的简称，其语源有突厥语、古伊斯兰语、波斯语等融合演变而成，含意有“玉石集中之地”、“各色砖房”、“初创”等不同的解释。

今日的喀什地区古代称疏勒、任汝、疏附，包括古代的疏勒（今喀什市、疏附县、疏勒县、伽师县一带）、蒲犁（今塔什库尔干）、莎车、依耐（今英吉沙和阿克陶境内）、乌禾宅 （今塔什库尔干南部）、西夜（今叶城）等诸国地。^[1]

秦末汉初，属于匈奴的僮仆都尉管辖。汉武帝元狩四年（公元前119年），汉博望侯张骞奉旨通西域时进驻疏勒，这里始为汉朝所控制。公元前60年，汉朝在新疆设置西域都护府，喀什作为西域的一部分，正式列入中国版图。

唐太宗以后，这里为唐朝政府的重要军事据点，当时的安西四镇之一即为喀什噶尔。

五代至宋，先后为喀喇汗王朝和西辽所管辖。喀喇汗王朝时期，曾以喀什噶尔为首府。

成吉思汗西征后，属次子察合台太子的封地。叶尔羌汗国时，喀什曾作为辅助中心起着重要的作用。元代马可波罗行纪中曾对喀什专门做过描述，其也被翻译为可失合儿国（Kachgar)。文中对喀什的记叙如下：“可失合儿（Kachgar）曾经是一个王国，面积为五天的路程。不过，臣服于大汗，居民有自己的语言，主要信奉回教。其境内有许多被高墙厚垣围绕着的城镇，当然，这其中、最壮丽的就是可失合儿本城了。此地也在东方和东北方之间，居民多为工匠商贾。这里有幽美的园林，有葡萄园，有制造业，棉花产量很大。有不少从此地出去的商人，他们到世界各地去经商。不过，此地的居民都非常吝啬，生活窘迫，饮食很差。当地有不少聂思脱里派的基督徒，并有其本教的教堂。 ”喀什空港

清乾隆时期是中国政府“总理南八城事宜”的喀什噶尔参赞大臣驻地。

光绪十年（1884年），置喀什噶尔道，共辖有疏勒、莎车两个府和英吉沙尔直隶厅、蒲犁分防厅、和阗直隶州。改为喀什行政区，设行政长公署于疏附。

民国32年（1943）改名新疆第三（喀什）行政区，还有第十（莎车）行政区。

建立了喀什专区和莎车专区。1956年撤销莎车专区，并入喀什专区，1971年1月，喀什专区改为喀什地区。

1982年11月6日，将喀什市浩罕、伯什克然木、阿瓦提、英吾斯坦4个公社及河内林场划归疏附县。

1998年3月1日，将疏附县浩罕乡、伯什克然木乡5个村、阿瓦提乡2个村、帕哈太克里乡1个村、疏勒县城关镇1个村的3个村民小组划归喀什市管辖。

2003年末，喀什地区总人口3501198人，其中城镇人口81.95万人。辖1个市、11个县，共有8个区公所，26个镇、4个街，141个乡，2310个村委会、96个居委会。境内还驻有新疆生产建设兵团农业第三师所辖16个团场以及自治区属管单位、农场、石油基地、军事机关等单位。

2004年8月2日，经自治区政府批准，将疏附县的色满乡、荒地乡划归喀什市管辖。

2005年2月24日，经自治区政府批准，将疏附县的帕哈太克里乡、伯什克然木乡划归喀什市管辖。

2013年3月，自治区政府（新政函[2013]35号）同意将疏附县阿瓦提乡划归喀什市管辖；同年，自治区政府（新政函[2013]207号）批准同意将疏附县英吾斯坦乡划归喀什市管辖（11月20日正式实施）。

2014年10月21日，自治区政府（新政函[2014]194号）同意将疏附县阿克喀什乡划归喀什市管辖。